1、内设机构：

根据工作职责，本溪市自然资源事务服务中心（本溪市不动产登记中心）设6个内设机构，分别是党政群工作部、财务审计部、人力资源部、法律事务服务部、征地事务服务部、信息事务服务部。

2、分支机构：

根据工作职责，本溪市自然资源事务服务中心（本溪市不动产登记中心）设5个分支机构，分别是本溪市不动产登记中心、本溪市土地规划调查院、本溪市矿产资源咨询服务中心、本溪市规划设计研究院、本溪市测绘地理信息所